Основной задачей комиссии является взаимодействие федеральных и региональных органов исполнительной власти при решении вопросов территориального планирования, межбюджетных отношений и задач, касающихся развития регионов страны.
Комиссию возглавит Зам. Председателя Правительства РФ Марат Хуснуллин.